1957年8月31日,聯(lián)盟主席東姑阿都拉曼宣布馬來(lái)亞獨(dú)立。馬來(lái)文成為國(guó)語(yǔ),回教成為國(guó)教。東姑阿都拉曼出任第一屆的首相,并被稱(chēng)為國(guó)父。
在北婆羅洲方面,沙巴從1882年就被英北婆羅公司統(tǒng)治,直到日本軍隊(duì)在第二次世界大戰(zhàn)攻入占領(lǐng)為止。砂勞越則是英人查爾斯布洛克和汶萊蘇丹協(xié)議下所建立起來(lái)的白人拉惹布洛克的天下。從1840年直到1942年,它都由布洛克家族所控制。在世界大戰(zhàn)過(guò)后,沙巴及砂勞越正式成為英國(guó)殖民地。
1963年,馬來(lái)亞聯(lián)同新加坡、沙巴及砂勞越組成了馬來(lái)西亞聯(lián)邦。但1965年,由于東姑阿都拉曼及李光耀的政治分裂,新加坡宣布退出馬來(lái)西亞。
1969年的全國(guó)大選成績(jī),顯示人民對(duì)聯(lián)盟的支持急劇下降,反對(duì)黨所獲得的席位劇增。雖然聯(lián)盟仍然控制聯(lián)邦政府,但失去了吉蘭丹州政權(quán),并在多個(gè)州議會(huì)里面對(duì)強(qiáng)大的反對(duì)黨勢(shì)力。1969年5月13日,反對(duì)黨的勝利游行在不同種族的相互嘲諷及挑釁的過(guò)程中,演變成種族沖突及流血事件,造成百多人喪失生命,無(wú)數(shù)財(cái)產(chǎn)被摧毀。此歷史事件被成為513事件。
1970年,馬來(lái)西亞宣布實(shí)施為期廿年的新經(jīng)濟(jì)政策,其目的是要消除貧窮,重組社會(huì),以拉近貧富的鴻溝。但這項(xiàng)政策所實(shí)行的固打制,也使到非馬來(lái)人社會(huì)非常不滿(mǎn)。
1972年,第二任首相敦拉薩改變了外交政策,開(kāi)始和共產(chǎn)國(guó)家接觸,并致力使東南亞成為和平、自由及中立的區(qū)域。1974年,敦拉薩訪(fǎng)問(wèn)中國(guó),兩國(guó)的邦交自此一直密切發(fā)展至今。
1970年代,馬來(lái)西亞開(kāi)始其工業(yè)化計(jì)劃。新經(jīng)濟(jì)政策廿年的成果,已經(jīng)使到馬來(lái)人的經(jīng)濟(jì)地位大大提升。1991年,第四任首相馬哈迪醫(yī)生宣布推行為期三十年的2020宏愿計(jì)劃,致力使馬來(lái)西亞在2020年成為先進(jìn)國(guó)。
直到目前為止,馬來(lái)西亞仍然以每年超過(guò)8%的成長(zhǎng)率發(fā)展,成為其中一個(gè)世界上成長(zhǎng)得最快的國(guó)家。目前馬來(lái)西亞共有十三個(gè)州,兩個(gè)聯(lián)邦直轄區(qū)。其首都為吉隆坡,是其中一個(gè)聯(lián)邦直轄區(qū)。